通风控制系统可根据不同的情况采用不同的控制方式，为使各单台设备排风量达到设计要求，且确保每台通风设备在单独运行时不影响其它通风设备的正常运行，采用通风变频系统（变频方式：定风量变频/变风量变频）。

定风量变频控制：

机设备及管道的初投资较变风量系统高，但整体初投资还是较低。方案设计、实施简单，但实验室环境差、噪音大、能耗大。属于80年代的系统方案，比较落后，特别是不能满足日益提高的职业健康要求，已经是趋于淘汰的设计方案。定风量通风系统通常没有自动管理设备，由于有害气体是观察不到的，实验人员甚至无法知道通风柜是否正常排风，实验室负压是否正确，风机等设备出现故障也不能第一时间发现，造成安全隐患。通常采用自动管理设备，每个通风柜上有监视器，实时显示通风柜的运行状态及当前面风速，操作人员一目了然。系统出现不正常状态或故障时自动调整及发出报警，提高安全性及更合理利用资源。动力设备都是按初建设时满负荷设计和实施的，空间占用（通风管道）和动力设备（风机、动力站）都是最大配置且固定。当系统需要扩建时，原有动力设备都需要更换或增加，影响大，灵活性差。

变风量变频控制：

增加了变风量控制系统的初投资，但由于变风量系统利于参差性设计（通风柜同时使用率）使得空间占用和动力设备配置相对减小，可节约部分土建建设成本及风机设备和通风管道的初投资，但整体初投资还是相对较高。采用自动管理设备，每个通风柜上有监视器，实时显示通风柜的运行状态及当前面风速，操作人员一目了然。系统出现不正常状态或故障时自动调整及发出报警，提高安全性及更合理利用资源。利于参差性设计（通风柜同时使用率）使得空间占用和动力设备配置相对减小，可节约部分建设成本。并且当系统小规模扩建时，同样可利用变风量系统参差性，虽然通风柜数量增加，但同时使用率比原来降低，所以不必更换或增加原有动力设备，灵活性好。

文丘里阀控制：

采用文丘里阀的通风柜控制系统则能很好解决系统管网压力变化这一问题，文丘里阀能根据管网压力变化自动调整。这个过程是伴随管网压力变化同时发生，从而避免了由风速控制系统来调节这一过程， 实现了快速稳定的风量控制，它有两种不同的工作模式，即变风量和定风量。

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